Ayuda aplicacion hecha en java ejecutar en linux

OK primero lo más urgente: NO CORRAS EL PROCESO COMO ROOT. Es lo primero. Para ello, pues NO USES RUTAS ABSOLUTAS EN CODIGO DURO. Eso que haces de leer el directorio del usuario para pegarle lo de   está bien siempre y cuando la aplicación deba funcionar así, donde cada usuario tiene sus propios archivos.

Lástima que vienes a consultar ya que terminaste, porque te hubiera recomendado usar PostgreSQL en vez de mysql. Pero bueno, eso no es tan urgente. Aunque tal vez por ahí está el problema... mysql lo debes de correr como un proceso aparte y configurarlo para aceptar conexiones por TCP si es que está en otro equipo, o conexiones locales y pues configurar bien el URL, usuario y password en tu app para que se conecte al server de mysql.

Ni el cliente, ni el servidor deben correr como root.

mysql esta configurado para aceptar peticiones remotas.
la aplicacion Serevidor tiene la facilidad de conectarse dinamicamente. no tiene la ruta absoluta para su
conexion con la base de datos.

forma como se conecta la aplicacion Servidor con la base de datos
las aplicaciones cliente se conecta por medio de ip y puerto para localizar al servidor
ejemplo el servidor tiene la ip 192.168.1.240 y escucha por el puerto 1090.
los clientes necesitan estos datos para establecer la conexion con el servidor...

Ejecuta el programa desde la línea de comandos y revisa lo que dicen los errores.

El problema está que cuando lo ejecutas como root tiene permisos de todo ( por eso no lo debes de correr como root) y no salen errores. Cuando lo corres con doble click no estás viendo los mensajes de error que te salen.

Es probable que hayas pegado los archivos también con root y aunque estén en el directorio del usuario no tienen permiso para leerlos (chmod, chwon etc. etc )

Hasta que veas los mensajes de error sabrás que está pasando realmente.

ya esta checado de que cuando antes de ejecutar el programa toda la carpeta le aplico en chmod -R 777 nombredelacarpeta
con que nomas ejecute el programa en la terminar pues funciona todos los reportes... aunque lo ejecute normal o como root
pero como decia que lo ejecute normal con doble click ya los reporter no me muestra..

Cuando ejecutas el JAR utilizando dobleclick, el directorio de trabajo puede ser distinto a cuando ejecutas el JAR desde línea de comandos. Haz una prueba con:

En tu código, imprimes la excepción con  . Pero, cómo decía Oscar, con dobleclick no puedes ver esa salida (a menos que sea redirigida). Tal vez quieras usar un archivo de registro (logging) para ir imprimiendo cada excepción o mensaje. Puedes utilizar log4j o similar.

Algo menos complicado, es mostrar la excepción en un diálogo, incluyendo opcionalmente el stack trace. No obstante, este tipo de mensajes no deben mostrarse al usuario, sino algo más “amigable”.

Pon tus reportes (los archivos  ) en un paquete de Java. Los cargas así (por ejemplo):

¡Espero ayude!

~~~

estube checando por partes y poniendo los mensajes de JOptionPane
y lo que no alcanza a mostrar es en el parametro que le paso como ruta_dir

el codigo completo del reporte esesto..
 

puse los   despues del  
otro mas despues del segundo parametro que es la que esta de esta forma
  y este ultimo no logra capturar la ruta para los subreportes....
es mas como que los parametros no los toma en cuenta es ahi donde se pierde
y es ese problema de que mi reporte no lo muestre..
todos mi reportes ocupan subrerportes..
y como lo digo si lo ejecuto desde la terminal si funciona bien los reportes....

Si no ves las excepciones solo vas a estar adivinando, lo cual no es nada eficiente si es que llega a ser efectivo.

Reemplaza todos los usos de System.out por un logger que escriba a un archivo (java.util.logger es ya viene incluído en Java) y usa archivos de propiedades para especificar valores en vez de estarlos leyendo o calculando.

¡Ya me lo imaginaba! En Windows,   te devuelve el directorio en el que se encuentra el JAR que estás ejecutando con doble clic. Pero en Linux no te regresa ese directorio.

Hay otra forma de obtener ese directorio. Lo único que necesitas es una clase dentro del JAR. Por ejemplo, la clase   en el siguiente código:

 
~~~

Checando este es la ecepcion que manda. al momento de ejecutar la aplicacion Servidor.jar la cual el mismo programa si es ejecutado desde la terminal no ocurre dicho error;
de que el archivo no encontrado

esto pasa con linux.
porque el mismo programa se ejecuta normal en un entorno windows esto funciona si problemas...

Yup.   te está regresando  .

Tienes razon Jpaul ejecutando desde la terminal te da la ruta correcta en donde esta el jar...
 
pero ya ejecutando normal con doble click ya la ruta lo da diferente
/home/nombre_usuario
y concatenando con la ruta sobrante que esta en la clase /src/reportes/reporte.jar ya no es la correcta..
en cambio con esta linea de codigo
  te da la ruta correcta ejecutando normal o con la terminal

Gracias.. a todos.... por sus respuestas..